Dopo aver trasmesso il file di flusso il sistema EDI delle dogane procede a due tipi di controlli:
1. Controllo formale: durante il quale viene verificata la validità della struttura del file, della sua firma digitale e di tutti gli aspetti legati in generale alla forma dei dati. In presenza di errori nel controllo formale il sistema non procederà al successivo controllo sostanziale e produrrà solo un file di risposta nel quale saranno elencati gli errori riscontrati, è necessario in questo caso leggere il file di risposta generato andando al menù [dogane]>[prelievo risposte].
2. Controllo sostanziale: Se il precedente controllo formale ha avuto esito positivo il sistema procede al successivo controllo sostanziale durante il quale viene verificato il contenuto dei dati inseriti nel flusso. Il risultato del controllo è riassunto producendo un file di esito, disponibile al menù [dogane]>[prelievo esiti]. E’ importante in questo caso prelevare l’esito invece della risposta.